有关工伤问题，劳动仲裁结果出来后，企业不服起诉法院，我也不服，是否也必须起诉到法院

同志们好！先谢谢大家的帮忙了！我和单位因为工伤问题向劳动部门提起劳动仲裁，现在仲裁结果出来了，但单位因为假肢款问题不服向法院提出起诉，当初因为假肢问题我和单位签了一份协议，大概内容是：单位为我安装价值45000元的假肢，除社保报16000元外，单位补贴29000元，每隔六年更换一次，更换期限计算到70周岁前，若本人中途发生意外，补贴自然终止，若生存期间不需更换价值，则单位每隔六年补贴本人29000元。因为我现在要和单位解除劳动关系，所以要求一次性支付假肢补偿款360000元。仲裁结果比较折中，是按照45000元给20年的。但单位要求只按社保16000元给20年的。我也不是太满意，我觉得应该按协议支付，毕竟协议也是具有法律效力的。现在单位先起诉了，是不是如果我不起诉，法院就会只听单位的请求，到时还会达不到仲裁这样的结果。