怀孕女员工休病假问题

公司有一女员工，从怀孕开始一直请病假休息，未按照公司规定程序提交身体检查报告、挂号凭单，只提供了病假单和病历卡，公司多次通知补交，该员工不予理睬，后去就诊医院了解得知，该员工去医院只挂了号，做了一个B超证明自己怀孕而已，未做其他身体检查，但医生还是根据她个人要求以早孕的名义开了两周的病假单，之后两次就诊未作任何身体检查，医生仅凭她个人口述就诊断为先兆流产，分两次连续开了一个月的病假单，其中一张病假单和病历卡均有涂改，医生自称是自己写错修改的，没什么问题。因为疑点太多，公司怀疑该医生和该员工是熟人，后多次通知该员工，由公司同事陪同一起去其他正规医院做个复查，以便了解真实病情，被该员工拒绝，请问在此情况下，公司该如何处理？