改制时政府拨款解决遗留问题，公司股东会是否有权处置

在企业改制过程中，政府拨款解决原国有企业遗留问题，但政府国有资产管理等部门并没有明确解决那些遗留问题，这部分拨款大部分用于了银行还贷，其中一部分为了扩大企业资本金，记在了股东个人名下。因为当时改制后，企业资本金短缺到难以运转，股东会认为这也属于企业改制后的遗留问题，经股东会同意，按股东入股比例将部分政府拨款资金记在了个人名下。现在公司资产已出售，出售后分配资金时，将这部分记在个人名下的资金作为股份分配给了股东。现在检察机关在查此问题，认为是贪污国有资金或者私分国有资金。股东认为，解决流动资金不足也是遗留问题，现在要按贪污罪论处，请问有什么法律依据吗？