关于起诉对象的问题

求求大家能够帮助我，真的非常感谢。
我去年9月份进的公司，今年3月份被辞退了，在公司期间，12月份的时候发生了交通事故，同事让我载她去采购办公用品的时候，同事被摩托撞了，最后交警划分责任的时候，我跟摩托各承担50%的责任。现在同事将我连同摩托车主一起告上法庭了。请求帮助如下： 
1.我能起诉公司吗？公司应该帮我赔偿吗？ 
2.如果起诉公司，我该起诉哪个？因为我所在的公司是两个合伙人开的，9月份的时候根本没有注册公司，一直用的A公司的名称，而那时候A公司只是它的客户。今年年初刚注册了公司，用的其中一个法人上海的一个公司的分公司B。我到底是起诉A还是B还是两个法人？ 
3.如何起诉？是同事将我告上法庭，上法庭的时候起诉吗？怎么起诉？有哪些步骤啊？
拜托大家能不能帮帮我，真的非常感谢，因为我对法律真的不了解。