企业破产前，职工与公司签订协议转移劳动关系，破产时是否生效

我们公司由两个股东构成，现在企业不景气，部分职工在大股东所在公司工作，由于工伤等原因，企业想与职工限定一份协议（职工的劳动关系转移至当前工作的公司，如果公司要进行破产清算，劳动关系再转移回原单位，不影响职工的合法权益）这里要说明的一下，第二股东占45%的股份，且与第一股东存在非常大的私人矛盾，企业很可能马上就要破产清算。劳动关系真的还能转移回去吗？我想知道在这种情况下签订的协议是否合法，是否能保证合法权益，职工应该如何保护自己的合法权益。