商铺租赁纠纷

律师：新年好！
    我于2007年元月购买一商铺，并同时与开发商定立了一份租赁合同。租赁合同期限为5年，年租金按购房总价的9%支付，并计算出每月具体租金额与每年的租金额。前三年租金合计也计算出具体的数额，并直接抵作购房款，后两年支付给出租人（即购房人）。其余房款直接交了现金，并于2007年元月开具了购商铺的税务发票金额是47700多元。而我实际支付的是51000元，当时开发商说：“是为了让你们少交点办理房产证款才少写购房款的。至于真实付款额我们有记录，你看租赁合同也是按实际付款额计算的。”的确他们是按实际付款额51000元计算租金的（租赁合同上写了具体计算出来的租金额），所以我也就听信了他们的话。到了2011年下半年开发商（同时也是承租商）支付给最后两年的租金给我的时候，他们却少付给我1800多元。从他们的工作人员处了解到的理由是：以前的租赁合同计算有误，导致他们不仅多计算了租金，而且少收了我的购房款。扣下的钱是为了补齐这部分钱。
尊敬的律师，我能要回这1800多元钱吗？
   这1800多元是这样计算出来的：（租赁合同上写的年租金）4590元*2年（租赁合同最后2年应直接支付给我）=9180元，扣除办理土地证费用933元、房屋维修基金522元以及2011年7月份支付给我的5876元后，得1847元。其中4590元是2007年元月购买时按我的实付价51000元*9*计算出来的，但租赁合同中并未列明购房总价的金额，只写了计算出来的年租金额45900元。
    而开发商是怎么计算出只付给我5876元，我推算不出来，他们的财务人员说他们不知道，开发商避而不见。
    这1800多元是这样计算出来的：（租赁合同上写的年租金）4590元*2年（租赁合同最后2年应直接支付给我）=9180元，扣除办理土地证费用933元、房屋维修基金522元以及2011年7月份支付给我的5876元后，得1847元。其中4590元是2007年元月购买时按我的实付价51000元*9*计算出来的，但租赁合同中并未列明购房总价的金额，只写了计算出来的年租金额45900元。
    而开发商是怎么计算出只付给我5876元，我推算不出来，他们的财务人员说他们不知道，开发商避而不见。