房屋抵押贷款，本金已还，房子还被拍卖

您好！家父在1997年曾用自己房子在农村信用社抵押贷款5万用于养殖，后遭遇台风，血本无归。去年法院来家里查封房子，我们就主动去农村信用社还了5万本金。由于利息过高，想申请减免一些。我们多次询问这个利息减免事情，然后负责这个事情的银行客户经理，每次都推说在开会讨论，迟迟没有答复。一直到今年，我在网上看到，我们家的房子在拍卖。请问，农村信用社这样合法吗？我们有诚意去解决这样事情，银行当时答应还本金就去法院撤案，结果没有。我们该怎样拿回房产证。