社保中，公司承担的部分从个人工资扣除

去年9月份，我与A公司签订劳动合同被派遣到LC公司做外协人员。合同中规定A公司每月15日以现金或者银行转账的方式支付我5500元。在今年2月份，A公司开始给我缴纳五险，3月20日收到工资后发现社保中单位承担的部分也从个人工资中扣除了，随机询问A公司老板，答复是当初约定的5500是个死数（劳务派遣每个月都是固定的数目），所以A公司不可能再为员工出一分钱用于社保，A公司老板还说当然可能选择不缴纳社保，全额发放工资；如果缴纳的话则个人必须承担全部。请问怎么处理这种情况？我如果想辞职的话，是不是只有申请劳动仲裁后才能提出辞职申请（担心提交辞职报告后老板立即签字，劳动合同就失效了申请劳动仲裁也就没有合同依据）？