物流公司与电商公司合同纠纷

我老板开物流公司，之前和一个电商公司签了合同，合同内容里写了帐是月结，我们发给他们账单的五日内必须结清款项，否则公司有权滞押电商公司的货物；合同上同时也写了，如果有一方单方面解除合约，就要付10万元赔偿金。结果对方公司有一笔账3个月都没结，其他款项托了一个月，我们老板直接就不发货了，扣押他们的货除非他们付清账单，然后对方就和我们终止合作，但是对方没有任何书面表示，直接冲到我们公司把所有要发货的商品搬走，还扬言要告我们，因为对方是做淘宝的，延迟发货客户反应不好，所以对方直接就和我们撕破脸，我们老板怕他们把东西搬走了以后还是不肯结账，就把门锁了说结完账才可以搬，然后隔了一天对方把账结了，警察也来过，备过案他们把东西全搬了，还有监控录像都有，后来我们公司盘点发现他们搬走了几千件其他客户的商品，前去追讨，对方不理会反而质疑我们之前结账的账单不对，要求和我们对账，我想说都过了几个月了才跑回来和我们说当初账不对是不是故意找碴，还有这个情况该如何起诉？ps：我们公司在和电商公司签合同的时候，也和对方公司里的员工签了合同，一共是两份合同，里面除了赔偿金金额不同，其他都一样。意思就是员工瞒着他老板也在和我们做生意，该员工同时负责处理他们公司的业务和他私人揽下来的业务，此次撕破脸就是该员工闹出来的，他一直和他的电商老板说我们故意不发货，把错全怪在我们身上，反而对他不结账的事情只字未提。 怎么办啊怎么办，我们都不是学法律的，该怎么起诉呢？