关于毕业生档案管理

我是10年毕业的大学生，毕业时和一个大型制造性企业签订了合同，并且报到证上写是那个公司的名字。
工作一年半以后辞职，辞职式因为不懂档案这一块，所以直接办理了提档手续，把档案拿到了新公司。结果新公司去人事代理处办理代理时才发现我的档案还是学生档案，必须得有报道证才给落档。但是原来的公司已经把报到证给丢了，并且没有给办理转正定级。
现在该怎么处理？即使去补办报到证，因为现在已经超出两年期限，不能办理报到证改派，不知道新公司能不能给办理转正定级。
这种情况该怎么处理，有懂法的朋友给解释一下该怎么处理。
原单位在档案处理上是否违法，是否可以走法律途径要求对方给解决。