会被辞退吗？如果辞退会被写进档案吗？

我是一名孕妇，07年11月进入公司，并签订了为期三年的劳动合同，期间签订过两次培训协议都是为期三年，还有一份竟业避止协议，我在今年3月底才发现自己怀孕了，当时医生让我卧床保胎，故请了两个月的假（到5月31日.假条在公司），但两个月我依然不好，医生仍让卧床休息，否则还会流产，当时去不了公司我就打电话给老总和副总经理的，先给老总打的说过不去，只好电话请假，老总问我请多久，我说我也不知道多久，因为医生还让我卧床休息一段时间到胎盘长上去才行，老总同意了，让我再跟副总说下，副总也同意啦。（5月31日打的），然后7月5日副总给我打电话啦，问我能去吗？我说去不了，他在电话中说要么我克服下去上班，要么他只能再找人，7月20号公司又让内勤给我打电话，说让我去办辞职手续，我说身体好点就去公司，7月29日经理又给我打电话，意思还是让我去辞职，而且经理还告诉我，请假的假条一直没批，之前一直没说，8月3日又打电话我没接，就关机了，如果公司联系不到我，会不会自动辞退我？若辞退的话，会不会把记录写进我的档案里？可医生说胎盘低会流产，我有医院的证明，但是没寄给公司，还有我请假期间公司没给我发过工资！我该怎么办？