这种情况下我应该怎么辞职？

我在公司上班，公司给交五险一金，有劳动合同。我是2012年9月15日在上班途中发生车祸，座的公司的车，经交警处理我们公司的车次要责任，对方主要责任，我自己无责任。出事后公司给出的医药费大概18000左右，在住院期间公司没有给我报工伤，公司人事部安环部和办公室相互推脱，都不愿意管这事，出院后我自己去社保局报的工伤，社保局予以认定工伤，做了伤残鉴定是9级伤残。因为我这个又属于交通事故也属于工伤，因为公司不管，我就自己花了3500元找的律师起诉肇事方，因为我还在公司上班没有起诉公司，自己花了2500元做的司法鉴定是双十级伤残，法院判赔我6万多点，其中包含18000左右的医药费和3万多的伤残补助金，肇事方全赔了（双方的车都有全保基本全是保险公司赔的）。社保局的赔偿还没有赔，请问社保局还要赔偿哪些费用？是不是伤残补助金和医药费社保局都不赔了？
因为感觉公司太不人性化了，我在这个公司认真工作，出了事也没有起诉公司占的次要责任，出事后复查去都要请假（我们公司在矿上，我们平时周末加班不发工资但是可以调休，我复查去必须用调休）。所以我决定辞职，我是9月10日打的辞职报告，部门经理和人事经理都批准了，公司主管领导还没签字。但是今天公司给我要18000左右的医药费，说不给医药费就不给我办离职手续（这医药费是我们矿上安环部经理在财务借的款）。请问我需要给公司医药费吗？如果我给公司医药费的话我交的律师费是不是公司应该给报？我不给医药费能不能在10月10日满30天时直接走？公司是不是在我辞职后公司应该支付我就业补助金和医疗补助金（公司说社保赔过后在给我这些补助金，这样成立不成立？）？还有公司说工资只赔付就业补助金，医疗补助金应该由社保局赔，公司说这是2013年的新规定，是不是这样的？