员工辞职被要求返还部分工资报酬

您好 我是刚毕业的大学生，于7月1号与公司签订了期限3年的劳动合同，由于个人原因于9月30日提出辞职申请，老板也同意了，但在我索要9月的工资是出现了问题，公司是每月15日发上个月的工资的。老板提出第一点：合同里有一项条款，如员工未满期限辞职，必须将已发放的工资高于基本保障1340元的部分作为诚意金返还公司（本人拿到手里的是2000左右）。第二点：合同里提供员工免费住宿，但后来老板让我签了另一份协议，规定凡是未满期限提出辞职要求返还前面所有住宿费，每月500，我整整3各月一共1500元。试用期为3个月，我是在试用期内提出辞职的。另外公司当初只与我签订了一份合同，在老板手里。但合同一般都是2，3份的吧，当时没注意，现在不知是否具有法律效力。就这3点希望能给点建议 谢谢诶