房地产开发商违约拖延收房、房产证办理的损失，由谁来承担？

律师：
     你好！
     我和家人前几年在涪城区东方红大桥附近某楼盘买了两套商品房（一套按揭 、一套付全款）。目前，有两方面情况需要向律师咨询、请教：
     第一、去年10月，该小区所在房地产公司开具了交房通知书。我们第一次和小区物管人员一起验房，发现住房内存在着多处程度不同的质量问题，例如厨房、卫生间的防水保护层未做、防水高度不足1.8米；卫生间的排水管未定位、架管未处理；多处窗户的封口浆开裂、未封堵、缝隙拱起；阳台推拉门关闭不严，防护栏有锈蚀；进户防盗门有碰损、划痕、凹凸变形等。我们当即提出进一步整改的要求，物管人员同意会转告房地产公司。
     接下来的一年里，在该小区所在房地产公司和物业中心没有通知的前提下，我们先后三次主动到小区查看、准备收房，但是房间内的问题大部分没有解决，不能令人满意。
     今年10月，小区物业中心经理提出建议，双方签份协议：免收收房期间的一年的物管费（每套住房的物管费一年是1282元），条件是两套住房内目前存在的问题由我们自己承担、处理。
     商品房买卖合同上注明：买受人同意收房，出卖人按国家相关标准负责并修复并承担修复费用。
我们觉得不妥，由于开发商未能及时整改，我们一年未及时收房，给我们造成了未能及时装修、入住或出租的损失。
第二、商品房买卖合同上注明：出卖人应当在2012.7.28之前，取得该商品房所在楼栋的权属证明。若超期未能取得，出卖人保证在60日内办理。
今年7月，小区所在房地产公司才告知小区住户开始交验办理房产证的资料，并答复最快在年内才能取得房产证。
针对以上两种情况，我们该怎样维护自己的合法权益？