关于离职年终奖克扣相关纠纷咨询

各位律师好！

我的情况是这样的：
——2009年8月入职，有签订《劳动合同》和《薪资协议》是5000元/月，年底双薪，也就是一年13薪。
——2011年7月，公司薪资改革，签署《薪资结构变更协议》，由于升职，基本工资改为6000元/月，而关于年终奖的描述如下：
乙方可根据公司的经营业绩，个人工作绩效获得0—3个月（以基本工资为基数）的年终绩效奖金，具体评定的线性标准在每年的年度经营计划及个人绩效中明确。
——2012年由于公司计划上市，管理人员的年终奖改为年前发50%，年后6月份审计结束后发剩余。但这条属于公司单方面规定，未与员工签署任何协议，也未体现在任何文件中。
——2013年结束后个人获得的绩效评分在90分。
——计划在2014年1月26日离职，年终奖计划在25号发放，而此时公司给出的回复是由于2014年6月份我不在职，所以年终奖只能发50%，也就是6000*3*0.5=9000元，剩余的6000*3*0.9-9000=7200元就不发给我了，公司理由是公司体系文件KPT考核标准中规定的个人年终绩效奖金发放需符合以下条件：
1. 绩效评估时已入职满3个月
2. 在绩效奖金发放日仍在职
3. 在规定时间内完成了绩效评估

个人认为：

1. 绩效评估是年度要求，从2013年1月1日——2013年12月30日，期间我是在职而且按时完成了绩效评估，所以按照合同约定，应该给我6000*3*0.9=16200的年终奖励。
2. 年终奖励50%年前50%年后的发放方式从来没有得到员工的认同或合同规定，如果公司一定要坚持这样的发放方式我也同意，但是年后剩余年终奖克扣不发是不对的。
3. 公司体系文件中的规定是与薪资协议相冲突的，所以应该是无效的。

综上，个人认为公司的做法是不妥当的，请各位律师给出专业意见，如果就此申请劳动仲裁的胜算有多少？