逾期应付款的时间从什么时候计算

您好，今年3月底购买了一套住房（清水现房），当时说要用公积金贷款购买，销售说要按照房款总价的2%收取手续费。后来，国家出来调息政策，地方也出台了配套措施，大家都说公积金可以自己去公积金中心办理，于是我在上月提交了申请，公积金中心说需要排队，大约六月下旬受理。请问，因自己办理公积金贷款，贷款下来得较晚（售房的说他们有关系可以提前），我想知道关于“逾期应付款”指的是购房合同中到期应付款与改期实际已付款的差额，这个时间是从什么时候开始计算的？
 
第五条 付款方式及期限
3、按揭付款：
本商品房总成交金额    元整
（1）2015年3月30日前支付手气房款    元整
（2）余款     元须在2015年3月30日前办理完毕公积金按揭贷款手续