实习生扣工资

我们是实习生，只签了协议，从2011年2月20日实习到2011年7月31日。因为学校接二连三的考试，学校曾和公司协商，公司答应日期变为5月31日。但因为公司是做图书编目的，在全国各地都有业务，大部分都是与各地学校有业务。有一部分同学被派往上海的高校，剩下一部分同学仍留在北京。实习期间，在上海的同学因为挣得工资只有1000多一点，达不到上海人均收入，所以向公司提出辞职。而正好当时也到了5月底，好多同学就因为公司克扣严重为由纷纷离开。甚至一些老员工都走了。而上海的高校突然说中途走人要扣钱，但我们做的业务公司签的合同上没有这条。
现在公司已上海这边扣钱为由，不给我们这批实习生工资。
他们这么做我们应该怎么办啊？