法律咨询，公司处理不当

胡律师您好，2013年6月1日我公司发生氟化氢气体泄露时间，公司组织员工出去对周边农作物进行赔偿事宜，我和另外一名同事吴勇一组，按当时规定，我公司员工负责登记、测量受损面积，是否受损和受损程度由林业和农业部门人员确定，镇政府人员安排行程，去什么地方，当时安排我们去一个地方测量白皮松树苗，但是林业和农业部门的人没有去，在政府和村上人员的已在要求下，我们对当时的地皮和植被情况做了统计（面积、株距、苗高），没有在公司统一表格上作登记，随便在笔记本上记着，回来途中，村民要求知道他的丈量情况，我便把当时的测量情况抄了一份给他，回公司把当时情况报告给公司领导，因数目巨大，是否受损无法判断，第二天我们就到别的地方去了，此事告一段落。现如今，村民已将苗木旋耕，村民将我公司告上法庭，其中我留的纸条（苗高、株距、面积）成为证据，一审判决公司赔偿83万元，现公司追究责任，因我们的过失，对公司造成损失，按照公司相关制度，损失1万元以上，属于严重违纪，予以辞退并追击经济损失。  
    我想问一下，公司处理是否合理，我们应该怎么办？