医院合同制护士离职违约金和档案扣押问题

老婆在本地一家大型公立医院工作，14年10月上班，15年1月签订了2年期的合同，合同有规定违约金一万元，但是没有竞业限制协议和培训进修协议。

现由于考上了事业编，3月1日需要到新单位报到，医院以合同未满为由，要求缴纳1万元违约金，如果不缴纳的话不给办理离职手续，并且会扣押人事档案（人事档案当初是以医院的名义挂靠在本地人力资源局），请问医院的这种做法是否违法？我需要收集那些材料和证据来维护自身权益。