我是公司，有一个员工试用期离职，在试用期内工作没有达到要求，并且有请假和多次迟到

我是公司，有一个员工试用期离职，在试用期内工作没有达到要求，并且有请假和多次迟到，离职日谈话发他基本工资，扣除了月的绩效和奖金，他在离职手续中也有签字。离职交接表中注明（离开公司之日止与我公司不存在任何为解决问题）他有签字，工资于2日后发给他了。之后他提起仲裁，要求补发他2个月扣除的绩效和奖金部分。他的理由是不知道公司的考勤制度和工资结构，必须全额补发。制度和工资结构入职第一天就说了，但他不承认。仲裁机构说不采纳（离职交接表）的证据。公司是指纹打卡机打卡。想咨询一下这种情况如何举证处理。