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第1条 为促进投资及国际贸易，行政院得依本条例之规定，选择适当地区，划定范围，设置加工出口区。
第2条 加工出口区之设置及管理，依本条例之规定；本条例未规定者，适用其它有关法律之规定。但其它法律之规定，较本条例更有利者，适用最有利之法律。
第3条 本条例所称区内事业，指经核准在加工出口区内制造加工、组装、研究发展、贸易、咨询、技术服务、仓储、运输、装卸、包装、修配之事业及经经济部核定之其它相关事业。
本条例所称在区内营业之事业，指区内事业及其它经核准在加工出口区内设有营业或联络处所之事业。
第4条 经济部为统筹管理各加工出口区，应设置加工出口区管理处(以下简称管理处)，除管理处所在地区外，得于其它加工出口区设置分处，隶属于管理处。
前项管理处及分处之组织，另以法律定之。
第5条 管理处掌理左列有关加工出口区之事项：
一、关于各分处之监督及指挥事项。
二、关于申请投资在区内营业之事业之审核事项。
三、关于各项设施之筹建事项。
四、关于财务之计划、调度及稽核事项。
五、关于业务之企划及研究发展事项。
六、关于吸引投资及对外宣传之筹划事项。
七、关于保税仓库之设立及经营事项。
八、关于储运单位之设立、管理及经营事项。
九、关于加工出口业务之行政管理事项。
一○、关于公有财产之管理及收益事项。
一一、关于土地使用管制及建筑管理事项。
一二、关于工商登记、管理及建筑之核准发证事项。
一三、关于工厂设置及劳工安全卫生检查事项。
一四、关于工商团体业务及劳工行政事项。
一五、关于产地证明书、再出口证明核发事项。
一六、关于货品输出入签证事项。
一七、关于外汇、贸易管理事项。
一八、关于防止走私措施及巡逻检查事项。
一九、关于公共福利事项。
二○、其它依法律赋予之事项。
前项第九款至第二十款事项，于设有分处之加工出口区，得由分处掌理之。
管理处及分处业务管理规则，由经济部会商有关机关定之。
第6条 在区内营业之事业之种类，由经济部视经济发展政策及加工出口区之位置、面积等情形定之。
第7条 区内事业货品输往课税区者，比照进口货品之方式处理。
第8条 区内事业之废品下脚处理办法，由经济部定之。
第9条 加工出口区之左列事项，由各该目的事业主管机关设立分支单位或派员，受管理处或分处指导、协调办理之：
一、税务之稽征事项。
二、货口输出入之验关及运输途中之监督、稽查事项。
三、邮电业务事项。
四、电力、给水及其它有关公用事业之业务事项。
五、有关授信机构之业务事项。
六、有关检疫及检验之业务事项。
前项分支单位，以集中管理处或分处内办公为原则。
第10条 申请设立区内事业者，应填具申请书，并检附有关数据，向管理处申请或向分处申请核转，由管理处会同有关机关审查核定；其审查办法，由经济部定之。
经核准设立之区内事业于设立完成后，由管理处或分处发给营利事业登记证。
前项营利事业登记证，包括工厂登记、商业登记、营业登记及特许登记。
第10-1条 申请在区内设置营业或联络处所之事业，应填具申请书，并检附相关数据，向管理处或分处登记。
在区内设有营业或联络处所之事业登记事项有虚伪不实情事，管理处或分处得撤销其登记。
在区内设有营业或联络处所之事业有左列情事之一者，管理处或分处得废止其登记：
一、未依照登记事项经营。
二、自行停止营业三个月以上。
三、届期未办理变更登记。
四、有第二十二条之一至第二十六条规定之情形，经管理处或分处依第二十七条规定勒令出区。
五、租借厂地期限届满，未续(另)订租约。
六、经有关主管机关撤销或废止其公司、商业、法人登记或专门技术人员之资格者。
在区内设有营业或联络处所之事业，结束在区内营业时，应向管理处或分处申请注销其登记。
经管理处或分处依第二十七条规定勒令出区者，二年内不得重新申请登记。
在区内设有营业或联络处所之事业，其登记之申请条件、程序、撤销或废止、变更或注销及其它应遵行事项之管理办法，由经济部定之。
第10-2条 在区内营业之事业除前二条以外之其它申请事项，均由管理处或分处核办或核转有关机关核办之。
第11条 加工出口区内之土地(以下简称区内土地)，属私有者，依左列方式办理：
一、依法征收，并按市价补偿之。
二、由土地所有权人以地上权设定方式提供管理处开发。
三、由土地所有权人依管理处开发计划自行开发或与管理处共同开发。
前项第一款之市价，指按被征收土地原使用性质相同土地之一般买卖价格而言。
在区内营业之事业得依其需用情形租用区内土地，除依土地法给付土地租金外，并应负担公共设施建设费用。
前项土地租用及费用计收标准，由经济部定之。
加工出口区内之厂房、建筑物，得准由在区内营业之事业自行兴建或由管理处自行或由公民营事业投资请准兴建租售。
第11-1条 加工出口区内得划定一部分地区作为社区，由管理处配合加工出口区之需要，作有计划之开发及管理；其涉及土地使用之拟订、编定或变更者，应依都市计划法或区域计划法之规定办理。
前项社区之开发及租用管理办法，由经济部定之。
社区内之建筑物，得由在区内营业之事业请准自建或由管理处兴建出租；
必要时，得开放民间投资兴建出租。
前项建筑物以租与加工出口区从业人员为限；其租金标准，由投资兴建人拟订，报请管理处核定，不受土地法第九十七条规定之限制。
第12条 加工出口区内私有土地或建筑物之转让，以供在区内营业之事业使用为限。
前项土地或建筑物有左列情形之一者，管理处或分处得协议价购或依市价办理征购之：
一、不供在区内营业之事业使用者。
二、使用情形不当者。
三、高抬转让价格者。
四、因更新计划需使用土地者。
五、依第二十七条规定应迁出加工出口区者。
依前项第一款至第三款规定取得私有土地或建筑物时，对于原所有权人或占有人存于该土地或建筑物内外之物资，得由管理处或分处限期令其迁移，逾期得代为移置他处存放或变卖或声请法院拍卖；其费用及所生之损害，由原所有权人负担；其经变卖或拍卖者，所得价款扣除费用后，如有余款依法处理。
依第二项第四款取得私有土地或建筑物时，对于原所有权人得优先核配厂房或提供迁厂之土地，并补偿其拆迁停工之损失；其办法由经济部定之。
经解散之在区内营业之事业，其余留物资，应于二年内处理完毕。逾期由管理处或分处变卖或声请法院拍卖；所得价款扣除费用后，如有余款依法处理。
第13条 区内事业免征左列各款之税捐：
一、由国外输入机器设备之进口税捐、货物税及营业税。但机器设备于输入后五年内输往课税区者，应依进口货品之规定，课征进口税捐、货物税及营业税。
二、自国外输入原料、燃料、物料、半制品、样品及供贸易、仓储业转运用成品之进口税捐、货物税及营业税。但其输往课税区时，应依进口货品规定课征进口税捐、货物税及营业税。
三、取得加工出口区内新建之标准厂房或自管理处依法取得建筑物之契税。
区内事业产制之产品输往课税区者，按出厂时形态扣除附加价值后课征关税，并依进口货品之规定，课征货物税及营业税；其提供劳务予课税区者，应依法课征营业税。
前项附加价值之计算，由经济部会同财政部定之。
依本条规定免征税捐者，除进口货品仍应报关查验外无须办理免征、担保、记帐及押税手续。
第14条 区内事业从事转运业务者，得按其转运业务收入之百分之十为营利事业所得额，课征营利事业所得税。但总机构在中华民国境内者，其在区内之分支机构不适用之。
前项事业应依所得税法第九十八条之一规定，缴纳其应纳营利事业所得税。但不得适用所得税法第三十九条之规定。
前二项区内事业从事转运业务课税之申请程序、期限及其它应遵行事项之作业办法，由经济部会同财政部定之。
第15条 经济部得报经行政院核准于加工出口区内，划定保税范围，赋予保税便利。
第16条 区内事业免税之货品因修理、测试、检验、委托加工或提供劳务，而须输往课税区者，应经管理处或分处核准，并经海关查验得免提供税款担保。
但应在管理处或分处核准之期限内运返区内，并办理结案手续。
第17条 课税区厂商售与区内事业之货品，视同外销货品。
前项货品入区时，其须申请减征、免征或退还进口税捐、货物税及营业税或运返课税区者，除经海关核准者外，应向海关办理入区相关手续。
前项已申请减征、免征或退税货品运返课税区时，应按输往课税区时之价格及税率，课征有关税捐或补征已减免或已退之税捐。但机器设备入区已逾五年者，不在此限。
第18条 区内事业得将其货品在加工出口区内，作有关业务之储存、陈列、改装、加工制造及他项处理。但应具备账册，分别详细记载货品出入数量及金额，以供管理处或分处及海关稽核。
前项货品，得在加工出口区内无限期储存；如有缺损，应于十五日内申述理由，报请管理处或分处会同海关及税捐稽征机关查验，经查明属实，并有正当理由者，准在账册内减除。
第19条 区内事业输出入货品时，应向海关办理通关手续；其属贸易主管机关公告限制输出入货品项目者，应先向管理处或分处申请核准。
第20条 加工出口区内，除必要之管理人员、警卫人员及在区内营业之事业值勤员工外，不得在区内居住。
在区内营业之事业应将所属员工名册、照片，报请管理处或分处核发出入许可证。
进出加工出口区之人员、车辆，应循管理处或分处指定之地点出入，并须接受海关及警卫人员所为必要之检查。
第21条 管理处或分处为维护加工出口区之环境卫生、安全及办理公共设施，得向在区内营业之事业收取管理费；为办理第五条规定掌理之事项，得收取规费或服务费。在区内营业之事业并应于期限内缴纳。
前项收取管理费、规费、服务费之范围及收费标准，由经济部定之。
第22条 加工出口区应设置作业基金，为左列各款之运用：
一、加工出口区之开发、扩充、改良、维护及管理。
二、加工出口区开发及相关事业之投资或贷款。
三、加工出口区开发管理相关之研究规划、设计及宣导事项。
四、各项作业服务事项。
五、其它经行政院项目核准者。
前项作业基金之收支保管及运用办法，由行政院定之。
第22-1条 区内事业违反第十六条或第十九条规定，未经管理处或分处核准，将货品运入或运出加工出口区者，予以警告或处新台币三万元以上十五万元以下罚锾或停止其一个月以上一年以下货品之输出入。
第23条 区内事业违反第十八条第一项但书规定，不具备账册或为虚伪不实之记载或拒绝管理处或分处及海关之稽核者，处新台币三万元以上十五万元以下罚锾；经限期改正而未改正者，得按次连续处罚，至其改正为止；情节重大者，并得停止其一个月以上一年以下货品之输出入。
第24条 违反第二十条规定者，处新台币六千元以上三万元以下罚锾。
第25条 在区内营业之事业不依第二十一条规定缴纳管理费、规费或服务费者，处新台币六千元以上三万元以下罚锾，并通知限期缴纳，届期仍不缴纳者，并得停止其一个月以上一年以下货品之输出入。
第26条 区内事业有从事走私行为或其它违法漏税情事者，依海关缉私条例或其它有关法律之规定处理。
第27条 在区内营业之事业有第二十二条之一至第二十六条之情事，除按各该条处罚外，并得勒令该事业限期迁出加工出口区。
第28条 管理处或分处对区内事业产品出口价格得随时稽查。其经查获低报出口价格者，依有关法令处罚之。
第29条 本条例规定应处罚锾之案件涉及刑事责任者，应分别依有关法律处罚。
第30条 本条例所定之罚锾，由管理处或分处科处，并限期缴纳；逾期未缴纳者，移送法院强制执行。
第31条 本条例施行细则，由经济部定之。
第32条 本条例自公布迩日施行。
