房产纠纷

我爷爷、奶奶生前留下房产。奶奶死后，因房屋拆迁，赔付两套住房一套门面。爷爷立下遗嘱：所有房产由我父亲一人继承，并到公证处公证（爷爷奶奶生前与父母共同生活在爷爷奶奶的房屋中，长达20多年。其他姊妹只是逢年过节进行探望。爷爷奶奶如遇生病住院也是父母亲自照料，其他姊妹只是进行探病）。爷爷死后，父亲其余姊妹不愿承认该遗嘱。父亲便与他们商议并签下如下协议（未公证）：其中一套房屋由我父亲继承；另外一套住房和一间门面变卖，分成八分(六兄妹每人一份，爷爷奶奶各一份），父亲继承三分（自己和爷爷奶奶的），并从变卖的房产金额中（父亲单独继承的一套不算其中）归还父亲在接房时所交付的水电户头费、差平方补款、维修基金等费用。但现在他们又反悔了，不愿从卖房款中扣取父亲当初所付的费用。父亲一怒，也不愿再承认后来签订的协议。请问，现在这种情况该如何处理？