一、 性质不同。扰乱单位秩序行为属于违反行为；单位职工一般性的无理取闹属于违反单位纪律行为。
    二、两种行为造成的后果不同。扰乱单位秩序行为致使单位的工作、生产不能正常进行；单位的职工一般性无理取闹，主要是对于本单位内部一些问题处理不满而采取过激行为，但这些行为不足以影响工作、生产秩序的正常进行，并且通过说服教育，能够得到劝阻、制止，没有造成其它后果。
    三、 两种行为的处理不同。前者依据《治安管理处罚条例》，可以处以拘留15日、200元以下罚款或者警告；后者依据单位规章制度以及纪律给以单位内部行政处分或教育，只有屡教不改、情节严重的，才可以给予。