关于离职后工资发放问题

我是9月份10号跳槽到一家新公司上班，在10月7号晚提出辞职（因家庭原因暂时要去外地）在8号上午办离职手续，之后跟我核对工资按9月份出勤情况算下来2000左右，我们跟公司签的都是第三方合同，合同上写明是在20号之前发放工资。公司内勤说因为我们武汉这边都是首期交两个月的医社保，就算换个公司换了第一次还是要交两个月的。然后说我是在两个月之内辞职，9月份按我出勤天数五险一金我自己要承担23%左右，其余的公司出（我们社保差不多一个月自己出380左右，公司出780左右）。但是说因为10月份我没有上班而辞职，所以10月份的五险一金自己要出全部，两个月加到一起差不多1487块钱，要我把这钱补给他们才能给我发9月份工资。另外还要我把当时签的合同盖章的那一页交回去才算交接完毕，否则还要扣100块钱我那份合同没交的话。我8号回来就去查了自己医保卡，一分钱也没多。本身五险一金就是在发放工资的时候才缴的，现在让我先补1487给他们，公司才会在20号左右给我发工资，不然说还要拖到11月份。主要问题两点，1：补五险一金的1487块钱才给我发我9月份薪水我觉得很不合理。2：合同一式两份，为什么我要交给公司才行，否则还要扣我的工资。请问下我该怎么办？