怀孕被降薪，公司篡改合同规避，如何维权？

2010年7月进入公司，当时公司给了合同让我签，但没有签回给我。期间多次要求，公司一直以合同在总公司为由推拖没给。直到这个月，因为深圳因大运会要求企业为员工办理就业登记，需要提交合同原件审核这个契机，我才看到了我的合同。
合同的甲方为上海XXX公司，地址为上海。落款和骑缝章却是上海XXX公司深圳分公司。
合同的内容被公司篡改(当时我自己只填写了试用期工资为6000元，劳动报酬的部分被公司篡改为基本工资1800元。)
我前几个月怀孕，公司知道后，就按照基本工资1800来给我发工资，并说其他是绩效工资。社保一直是深圳分公司给我缴纳的。

我想咨询一下：
1.此合同甲方写的是上海公司，但盖章是深圳分公司的章，这个合同是否有效？深圳分公司有注册地在深圳的营业执照和税务登记等资质。

2.我除试用期外，大半年实际发放的工资都大于6000元。公司给缴纳的社保基准也是2000多元，考勤(请假)也都是按照6000多的标志来扣的，而不是按照1800.
  6月份公司已经按照1800的标志给我发工资(请假又变成按照1800均摊扣款)，我怀孕后的收入少了一大截。我该如何维权？