要求公司支付加班费及赔偿金

律师,您好！我是惠州博罗一家日资企业的员工，我想要求公司支付我2年半的加班费，以下说明我的情况：
 我跟公司签订的劳动合同如下：
第一份合同：期限2009年1月05日至2010年01月04日   正常工作时间工资按 21.75天2000元/月执行，初始工资额为2000元/月或11.49元/小时。没有签订任何工资约定。
    第二份合同：期限2010年1月05日至2011年01月04日   正常工作时间工资按   /   执行,初始工资额为2000元/月或11.49元/小时
  也没有签订任何工资约定。

第二份合同到期后：2011年1月4日公司变更劳动合同期限延至2013年1月06日止，并同时签订了附件（薪资待遇管理办法）, 附件并未提交给劳动部门备案,但附件中说明有含加班费。

但我的实际工资总额是5400元/月（工资组成公司分了好几部分:基本工资2000元，业务奖金1300元，职务奖金900元，技能奖金1200元）


 我入厂时跟公司谈的是税后工资，公司为了少交个人所得税和为了少交保险所以合同上只写了2000元，公司每个月交到地税的我的个人所得税只有37元，现在公司为我购买社保也是以社保局规定的最低工资买的。
   如果我不签的话，就将意味着我将要失去工作，无奈之下，只好签了工资额与事实不符的劳动合同。
   问1：劳动合同工资额与事实不符，能否申请这部分无效或不完整，以实际工资为准。

   入厂后公司要求我每月加班76个小时，（平时加班44小时，双休日加班32小时）
（即周一至周五每天晚上加班2H，每个周六加班8H）

公司有打卡记录，本人手上只有一份2011年4月份的加班统计，同事愿意为我作证人，可以证明我加班了。

2009年上半年因有人跟公司要求支付工资以外的加班费，后来公司将原来的业务奖金1300元改为劳务加班费1300元（修改内容并没有跟工会或职工代表协商，也没有告知本人，其行为违反了劳动合同法的第四条）

问2：以上公司擅自修改工资组成是否有效? 


问3：本人想要求公司支付2年半的加班费（2009年1月到2011年7月止），加班费计算基数应按多少算，我能拿到多少加班费?(期间本人休了4个月左右的婚假及产假, 4个月没有加班)


问4：本人以公司未支付延长工作时间的加班费为由，提出书面辞职申请，公司没有盖章但同意本人的辞职，我是否可以以：公司安排加班不支付加班费为由要求公司支付赔偿金?赔偿金有多少钱?



问5：请律师您代本人处理，费用怎么收?


本人持有资料：  1.两份劳动合同复印件（原件公司没给本人）
                2.工资条：2009年1月份至2011年6月份(共30份工资条：其中8份写的业务补贴，23份写劳务加班费)
                3.公司有打卡记录，本人持有一张IC卡,有一份2011年4月份的加班统计，同事愿意为我作证人，可以证明我加班了.
                4.地税的2010年的本人的实缴税款清单,可以证明公司少缴了个人所得税.(我是税后工资)
                5.社保公司按社保局公布的最低工资缴费的，社保局可以查实缴费记录。
                6.本人的离职申请表一份（复印件，公司没有盖章）。