程序是指公民、法人或者其他组织行使司法赔偿请求权，要求有关的国家侦查、检察、审判、监狱管理机关确认和履行司法赔偿责任的程序。作为国家司法赔偿制度的重要组成部分，是受害人实现司法赔偿请求权的有利保障。司法赔偿程序一般由遭受侵害的公民、法人或者其他组织提出赔偿请求而启动。赔偿请求应当向负有赔偿义务的有关国家机关提出。司法赔偿程序是有关的国家机关确认和履行司法赔偿责任的程序。司法赔偿程序的规定，明确了有关国家机关确认司法赔偿责任的行为及赔偿义务机关履行赔偿责任的行为规范，既为受害人及时得到赔偿提供程序上的保障，同时也是对有关国家机关及时结案、尽早确定权利义务关系的保障。