以药养医的现象一直受到社会各界的诟病。陈竺在报告中提出，要“实行医药收支分开管理，逐步取消以药补医机制，切断医院运行与药品销售的利益联系，降低药品价格。”

　　此外，为搞好公立医院改革，陈竺在报告中还提出了一系列的相关配套措施：采取增加财政补助、适当提高医疗服务价格等措施，完善公立医院补偿机制，规范收支，加强财务监管;改革人事制度，完善分配激励机制，体现医务人员的技术劳务价值，充分调动医务人员的积极性，不断提高医疗服务的质量和水平。

　　陈竺表示，改革就是要坚持以公立医疗机构为主、非公医疗机构共同发展，最终“形成布局合理、分工明确、防治结合、保证质量、技术适宜、运转有序的医疗服务体系”。