公司这样做是否合理合法？

本人在一家公司上班，是该公司的一名员工。工资是按多劳多得的形式（无底薪）每月发放。今年春节期间（1月份）由于春节长假和年末工程量少，及公司计提的工资金额缩减，导致在1月份的工资收入低于本市最低工资收入标准（我所在该市的最低工资收入标准为1400元/月，而我们班组人均工资收入仅仅只有400多元）为此公司已借支的方式给我们班补够了1400元的1月份工资。到5月份工程项目渐多，工资收入在4月份为2500元，现在公司对我们说要扣回1月份借支给我们的1000元低保工资。请问律师们，公司这样的做法是否合理合法？我们该不该把公司补贴的低收入保障1000元归还给公司？如果公司持续工程量不能满足我们工人每月的当地最低收入标准，我们是否会变成长期给公司做工，反过来还要倒欠公司一笔生活补偿金？