劳动合同里违约金问题

当时签的合同时，用人单位又让我们手写上未干满三年需赔偿违约金20000，加上期间发放的安家费5000，以及工作期间发生培训的费用2500。我现在干了快两年，差不多半年的工资没发，想辞职了。我要是赔了，我是不是等于这两年白干了？打官司也感觉没啥胜率，对方是国企，毕业证学位证档案都压在他那了。以前辞的同事都说他赔了不少，不知道是真是假。我现在真后悔在国企工作，太黑暗了。人家都说不定在当地把关系都打通了。签的合同都是非要约定法人当地法院调解。