德邦物流能否用旷工12天的理由扣除我已上班天数的工资？

我是一名德邦物流的营业部经理，今年7月份想离职，就和上司沟通，并且走了离职工作流，上司一直让我在考虑考虑，就托着我的工作流不批。到了8月，我的上司被公司免职，换了一个新的上司（因为公司流程问题，老上司免职后，他的办公系统还在公司内部，新上司上任后，有一段时间还是用的老上司办公系统办公），当时我就立即告诉新上司要离职，并且已经打了工作流，因为新上司系统还没变迁过来，所以我等新上司系统变迁过来（大概在8月10号左右）重新又打了离职工作流，新上司也批了我的离职申请（我们公司离职审批要逐级审批，后面还有很多部门审批），后期公司掉了一个接替我的人来上班，我就没有去公司上班了。
8月我累计在公司上班12天（全勤24天），之后我和接替我的人办交接，新上司用第三季度离职率太高，影响他考核，所以没在交接表上签字，让我10月即第四季度在去公司人事部办手续，可是等我9月末才发现我8月的公资竟然为负数，理由就是我上班12天，旷工12天，旷工扣的钱将我应得的工资全部抵消了，请问这种说法合理吗？