被开除又被扣钱，我该怎么办！！！

本人于12年5月入职一家上海企业（公司一），与公司在签订劳动合同过程中，因公司人事中途辞职，而未完成劳动合同的签订（我已在合同上签字，但甲方未盖章，我也没拿到我的那一份合同）。时至14年2月春节期间，我想利用年休假在家多待几天，2月5日我通过手机短信方式向公司领导（3人）请假，当时没有人回复同意或者不同意。2月11日我去公司报道上班，但公司通知我说“你未经批准又没有书面请假，违反了公司规章制度，作旷工5天处理，算自动离职，并承担旷工期间公司临时聘请外协人员的3000元费用”。
从12年5月至14年2月，上海企业（公司一）未发过我一分钱工资也没帮我缴纳过社保。其中12年5月-13年5月，由浙江平湖企业（公司二）缴纳社保及现金形式发放工资；13年6月-14年1月，由浙江嘉兴企业（公司三）缴纳社保及银行卡转账形式发放工资。公司一法人：陆一。公司二、三法人同为：陆二。公司三成立日期13年4月。我通过同事帮我查询过劳动合同甲方盖章情况，公司最近临时在此位置盖了2个公章，分别为上海企业（公司一）和浙江嘉兴企业（公司三）。
各位尊敬的律师，根据以上资料说明，有以下几个问题：
1、我需要承担那3000元吗？
2、劳动合同是否生效，如果不生效我应该对哪个企业要求赔偿？