公司以管理工程账目不清为由，拒放工资！

老板是老乡，在龙岗做消防配件生意，11年10月经朋友介绍到店里帮忙，没有签订劳动合同。初期工作内容：接听电话、打单、催款、管理账目反正什么都做，工资3800元。12年公司派我到惠来县管理工地，13年4月工地完工后，期间因甲方拖欠工程款时间较长，加上一个人同时管理几个工地，事情比较多没有时间及时回公司对账，公司也没要求定期回公司清理账目，最终导致其中一个工程账目混乱。
去年年底结工资时，老板以账目不清楚为由，拒发工资（工资2.5万+工程管理费1万元，共计3.5万未发）
原因：某一工程，其中5万多元不知道到哪了？
因为账目管理方面没有经验，加上公司账目本身就混乱不规范，跟老板之间大多数是口头告知，之前在工地所有开销单据都交还公司，我手头上并无什么有效单据证明。
5万多元，我并没有私自挪用公款，我让老板报警查我，我没做过，我不怕，但5万多元到底去哪里了，我还真是拿不出证明，可是如果我不拿回工资，对我来说，自己就是挪用公款，可是我并没有啊，我要捍卫我的声誉。
公司实质算是空壳公司，主要依靠老板能说会道，说不好听就是骗，供应商催款都是一拖在拖，根本没有什么信誉可言，公司经常加油钱和伙食费都拿不出，11年至12年单开空头支票被银行罚款近十万，13年开始这方面相对好一些。刚到公司工作的时候口头答应每月定时发放工资，可是从来没有定时发放，公司有钱就先预支一点，没钱就拖。
我现在的疑问：
1、公司以我管理的账目不清楚为由，拒发工资，这合理吗？
2、如果不合理，我应该如何拿回我的工资呢？
3、如可以申请劳动仲裁，想找个律师委托代理。
请律师帮帮忙，谢谢！13828113525蔡