咨询有关护照及赔偿金的问题

我是一名学生，通过学校与一公司签订了劳动合同，打算去非洲工作，但是合同未填生效日期，而且合同公司也没有给我一份。签合同时公司未提及保证金的事，后来到要办邀请函的时候又提及要交保证金。我没交，因为公司说可以要责任老师担保，但是我把老师的联系方式给了公司，公司并没有跟她联系，而是直接找的学生科长，最后他们沟通的结果也没有告知我，就办了加蓬的邀请函。但是由于近段时间，非洲地区战乱不断，而且埃博拉病毒疫情严重，家里人担心，于是我决定不去了。此时公司办好了邀请函，说要我赔偿5000元办邀请函的钱。我已让公司停止办理有关我的相关手续，但是之后公司一直没联系过我。我的护照和体检健康证还都在公司.我上网查询到出国邀请函的价格，一般在50-100美金，兑换成人民币也最多600多，我想请问公司要我赔偿5000是否合理？另外，护照如果要不回来，可以不要原护照，然后直接挂失补办吗？公司是武汉新洲区的，我的学校在武汉洪山区，我家在湖北洪湖，如果我要报警应该报哪个地方的110？