出租车乱罚款诉讼时效

您好！我是一名出租车司机，7月1日因我疲劳驾驶造成与一辆奥迪车追尾，是我全责。事故处理是由我垫付两车全部修理费用18000余元，再由我公司走保险获得保险公司的赔偿。保险公司有20%的免责赔偿，就是只赔偿全部损失的80%，20%的免责赔偿也就是3600元由我自己承担。但是到赔偿期我去公司领保险公司的赔偿金时却被我公司告知要扣我全部损失20%的罚款也就是又扣了3600元，令外再加上扣800元折旧费，总共加起来我被扣掉8000元。此次事故造成的全部损失为18000元，在我公司获得保险公司赔偿的情况下我个人还负担了8000元，请问我公司的这种做法是否合法？若不合法，我要申请仲裁或诉讼，诉讼时效是多久？是从事故发生开始算，还是从我一旦离职之日开始算？因为我现在还想继续开出租车，若不交罚款的话，公司会按违约辞退我。我现在先交了罚款，等我合同到期时也就是3、4年后再请求仲裁或诉讼可以吗？还有我公司若不给我上社保是不是也是违法的呀？那诉讼时效是多久呢？