在我国《独资企业条例》中，私营企业有三种形式：有限责任公司、合伙企业和独资企业，其中有限责任公司具有法人资格，其余两种形式均为自然人性质。企业登记管理的不规范，给确定企业所得税纳税义务人带来了许多困难。现行企业所得税不区分企业的法律地位，只要是独立核算的经济实体，在税收方面均作为独立的纳税实体，因此，税法规定的纳税人既包括具有法人地位的经济实体，也包括不具有法人地位的经济组织和实体，这种规定带来了许多问题。比如，总公司与分公司纳税主体难以界定。现行税法关于企业所得税纳税人的界定条件是：在银行开设结算账户，独立建立账簿、编制财务会计报表，独立计算盈亏，并进行工商注册登记的企业。根据这一规定，分公司应视为纳税人。但从企业设立分公司的目的上讲，主要是内部管理的需要，而且分公司不具有法人财产权，不能进行分配，不能独立承担责任，因此又不宜将分公司认定为企业所得税的纳税人。

　　本案所反映的问题正是如何合理界定纳税人。如果仅仅以是否设立账簿为标准来判断是否为纳税人，那么，一个公司就可能会成为多个纳税人。随着经济体制改革的深化和现代企业制度的建立与完善，我国企业所得税纳税义务人的规定更显现出局限性。以独立经济核算单位为纳税人，还存在着企业所得税和个人所得税重复征税的问题。按现行所得税条例规定，作为自然人性质的私营独资企业、合伙企业以及合伙制的各类事务所，对于企业的所得，按企业所得税法的规定缴纳企业所得税;对于个人分得的部分，还应当按照个人所得税法的规定缴纳个人所得税，从而构成了重复征税。国际上通行的做法是企业所得税只对法人征收，对所有自然人则征收个人所得税，对不具有法人资格的企业不征收所得税，只对股东取得的利润和其他来源的各项所得征收个人所得税。我国的《公司法》、《合伙企业法》、《独资企业法》对企业的财产与自然人的财产作了比较清楚的界定，这样看来，分公司没有法人资格，理应由总公司汇总纳税，由总公司完全承担纳税责任。合伙企业没有法人资格，属于自然人，应当缴纳个人所得税。对于没有法人资格而属于自然人性质的独资私营企业，应纳入个人所得税的征税范围。我国国务院决定，自2000 年1 月1 日起，对个人独资企业和合伙企业停止征收企业所得税，其投资者的生产经营所得，比照个体工商户的生产经营所得征收个人所得税。为了适应我国向市场经济进一步转轨的需要，应当改变上述三个简单的判断标准，借鉴世界各国的经验，采取法人税制，即以法人作为基本的纳税实体，这样有利于实施消除重复征税的所得税一体化措施。