2、公安边防部门要建立健全办案机制，确定以边境调查人员为主体的办案力量，增加必要的投入，以保证办案工作的实施。边境调查机构负责案件侦查工作的指导和侦查业务的基础建设。办案人员的配备，可在现有编制数额内进行调整。

　　3、公安边防部门管辖的一般案件由边防大队级单位负责侦办;支队级以上单位负责侦查重大涉外犯罪案件、重大集团犯罪案件和下级单位侦破有困难的重大犯罪案件，其中，总队以上单位主要负责组织、协调和指挥跨区域犯罪案件的侦查工作。

　　4、公安边防支队级以上单位在立案、侦查、采取刑事强制措施等方面行使相应的县(市)级以上公安机关的审批权限。县(市)公安边防大队办案，由所属县(市)公安机关负责人审批;地区(市、州、盟)公安边防支队(含海警支队、巡逻艇支队、广东边防五、六、七支队、特检站)办案，由支队(站)负责人审批;省(自治区、直辖市)公安边防总队办案，由总队负责人审批;侦办跨省(自治区、直辖市)案件，由省(自治区、直辖市)公安边防总队组织、指挥、协调或者直接立案侦查，报公安部边防管理局备案;侦办省(自治区、直辖市)重特大案件，由公安部边防管理局组织、指挥、协调或者直接立案侦查。

　　5、公安边防部门办理刑事案件，统一使用所属或所在地公安机关的法律文书，以公(边)字单独编号。即县(市)边防大队使用所属公安机关的法律文书;地区(市、州、盟)边防支队使用所属地区(市、州、盟)公安机关的法律文书;海警支队、巡逻艇支队、广东边防五、六、七支队、特检站使用所在地的地区(市)公安机关的法律文书;省级以上公安边防部门使用所属或所在地公安机关的法律文书。各级公安边防部门所需法律文书，可按所属或所在地公安机关文书的格式自行印制。

　　6、公安边防部门在侦查办案中，对已批准刑事拘留、逮捕的犯罪嫌疑人，交由所属或所在地公安机关看守所羁押;采取取保候审、监视居住等强制措施的，由犯罪嫌疑人居住地公安派出所执行。

　　7、公安边防部门承办的刑事案件，在侦查终结时，由本部门的法制机构审核把关，以所属或所在地公安机关的名义提请同级人民检察院审查批准逮捕，移送同级人民检察院审查起诉。

　　8、公安边防部门应加强同公安机关其他有关部门的协作配合。为及时、有效地侦破案件，打击犯罪，对发生在边境管理区和沿海地区(包括海上)的非边防部门管辖的刑事案件，发现犯罪线索或接到报案、举报、控告的，应立即接受，并按有关程序及时移送有管辖权的部门处理;边境地区和沿海地区(限于地、市行政辖区)公安机关有关其他部门发现的属边防部门管辖的刑事案件，发现犯罪线索或接到报案、举报、控告的，也应立即接受，并按有关程序及时移送边防部门处理。边境地区和沿海地区边防检查站在口岸查获的偷渡案件，除涉及《公安部刑事案件管辖分工规定》规定由刑事侦查部门管辖的第98、99、100种案件外，移交当地边防部门处理。侦查协作中出现分歧时，由争议双方共同的上一级公安机关协调决定。