房产纠纷问题

本人原有一处店面（没有房产证），后征地拆迁，与建设单位签订合同，合同主要内容：因拆迁补偿我一处店面，某幢楼某方向过来第二间，建筑面积不小于35㎡，水电排污房产证等甲方负责等。
    现工程已竣工，店面可以出租了。补偿在隔壁店面的看我的店面比较大（他的店面32㎡，我的实际有38㎡），伙同建设单位要我跟他对换，只补偿我6万元。前不久水电落户时甲方把我的店面登记到他的名下。现在店面可以出租，因房产证甲方还没给我，需要甲方开具证明，甲方也不予理睬。
    因为拆迁之前的店面两证都没有，我跟甲方签定的合同有法律约束力吗？或者说，到时候甲方不给我房产证，我能告的赢吗？因为甲方不给开具证明，除了我和隔壁那间的店面，其他都已出租，我这方面的损失能得到补偿吗？