一是明确改制转企形式和程序。事业单位改制转企要对原有国有资产全面置换，实行“国退民进”。在形式选择上，应结合单位特点，从实际出发。资产规模大、经营业绩好、发展有潜力的，可通过出售改制的方式，实行规范化的公司制改组，改为和；中小单位以民有民营为主导形式，可改为股份合作制、合伙制企业或有限责任制企业；规模相当小、数量特别多的，可采取兼并重组、租赁出售等多种形式经营；严重资不抵债的，可实行歇业破产，以避免改制后的无法运营。具体操作程序一般为：由单位提出改制转企申请，报有权部门批准；单位自行清产核资，再由主管部门向国资办申请立项，委托有资格的资产评估机构进行资产评估，评估结果经国资办审核确认；拟定改制转企方案，经职代会或职工大会讨论通过，报主管部门同意，并由单位主管部门转报事业单位改革领导小组，经审核批准后实施；同时，拟定单位人员分流分置方案，报送人事部门审核同意后实施；募集股本金，置换国有资产。转让价格由国有资产投资主体确定，国有资产出售收入由国资办统一组织收缴，并实行专项管理；召开股东大会，通过，选举董事会、，确立新的领导体制；按照现代企业制度，建立健全各项规章制度，建立和完善规范的法人治理结构。
　　二是实行社会政策保障。事业单位改制转企，首要的一点是保障职工的既得利益不受损害。目前大多数事业单位都参加了养老保险，但保险总量低、调剂余地小，单位和职工抵御风险能力较弱。这使得改制事业单位难以解决“人往哪里去”的问题。因此要从单位、本系统，乃至全社会统筹养老、医疗保险金，使职工“老有所养”、“离有保障”。对分流下岗人员，不仅要“减”而且要管，绝不能把分流人员推向社会不管，要对分流人员生活进行政策性扶持保障。同时，要大力实施再就业工程。建立和完善再就业服务体系，以发展促就业、以就业保稳定，开发性安置、创业性分流、自主性择业。要采取“先开渠、后放水”等多种办法，吸纳、安置分流人员。变就业为创业、大力培植新的经济增长点。
　　三是规范审计及国有资产评估行为。改制转企事业单位的资产、负债、净资产必须准确、真实，既不能限期限时、限定形式、有意低估资产价值，也不能对单位的会计报表只进行简单的核对审计，而应该委托法定机构按规范的程序依法进行资产清查和评估。在实际工作中，要坚持先审计后评估的原则，实行“三统一”。即：由事业单位改革领导机构统一委托，财政部门统一审计及评估要求，统一付费。对资产损失及增加负债等重大财务处理问题须报财政部门批准。对改制单位故意隐瞒资产(含私设的小金库和帐外资产)、虚列成本或虚增负债，人为压低净资产价值的，视情节轻重，依法追究有关责任人的法律责任。并按照公平、公开、公正原则，合理运用评估结果确定资产交易形式和交易价格，保证资产保值增值。