单位以质量问题责任未处理完为由停发离职前一个月的工资

过程介绍——本人2014年3月入职某公司，5月转正被任命为部门管理人员，7月主动提出离职申请，8月初单位销售人员邮件反馈某订单产品质量问题，8月6日因病前往医院就医直至9月初。8月7日公司人事部经理通知因质量问题责任未处理完且工作期间管理不善出现许多问题为由停发8日应发放的本人7月工资，本人虽然不同意，但经先后两天与公司领导及人事协商无果，最终被公司停发7月工资至今。8月中旬与单位人事协商趁看病医疗的间隙去公司办理工作交接、离职手续和停发工资发放及离职工资结算等问题时，单位人事以质量问题责任还未处理完和招聘新人未到岗及单位领导出差未在公司无法交接为由让我等待通知。8月底，公司销售人员反馈本次质量问题因客户索赔产生9万的损失，我曾与人事经理电话沟通中建议本人承担下属工作不力造成质量损失的部门管理职责，接受800~1000元的质量责任处罚。截止目前，单位一直要求我给出对自己的质量责任处理意见（人事经理称领导不同意罚款1000元的处理意见），并称公司根据法律有权对我进行工资的20%处罚。
目前状况——此前我一直努力与公司协商，但公司仍不能给出适当的解决。我现在想准备一下仲裁的材料，整理后发现如下情况：
1、劳动合同：面试时与公司老板约定了标准工作制，周末不用上班，但老板提出了工资待遇及发放形式——工资分两部分，50%写入公司的劳动合同，由公司财务按正常流程发放至个人某行的工资卡，而另外50%由公司老板安排以个人转账形式发放到个人其他银行的账户，并称其他管理人员都是如此操作，由于但是情况公司处于强势地位，我也没有提出否定意见。入职后人事和个人签订了3份通用格式的劳动合同，合同约定的工资数额为与老板协商工资的50%，且约定是六天工作的劳动合同，但没有发放到个人手中，为保险起见，本人和公司老板协商单独签订了3份按照上述描述的工资及发放形式的劳动合同，本人3份都签字了，老板以审核并盖章为由拿走，后给了我一份（因当时正在开会，会后检查了一下老板签字和公司盖章情况后就是没有太在意其他的，现在发现此份劳动合同侧面还盖有骑缝章，而写有工资待遇和发放形式的两页没有骑缝章，似乎老板故意没盖这两页）；
2、工资单：工资单不发给个人，只在发现金工资时让个人签字确认（试用期第一个月领现金时有过一次签字，但数额仍然是约定工资的50%）；
3、医保社保：公司人事与8月份停缴了医保社保，9月看病时个人不在享受医疗保险待遇，费用有所提高；
4、银行对账单：两个银行的对账单我打印了一下，只有工资卡的对账单显示标题为工资，另外一个银行的账户对账单相应项目只显示“他行汇入”的信息，询问银行工作人员和电话银行，对方均表示个人无法查询汇款人信息和汇款信息，除非公检法可以调取，建议我去报警，由公安局出面；
5、工资核算邮件：每月给老板发送的单独发放部分工资的核算表和该月考勤表；
6、工资核算及发放的沟通短信：3月、4月、5月三个月单独发放工资核算和发放情况与老板之间的沟通短信，6月工资核算情况有我的短信，但发放情况老板没有信息；7月工资核算情况有我的短信，但因工资停发，没有老板发放的信息，但有老板关于停发7月工资的信息；
个人主张——我想要求公司尽快发放7月和8月的工资，支付我拖欠7月工资的补偿金，我可以承担1000元的管理责任经济处罚，希望公司能够缴纳8月的社保医保，希望公司对因公司原因而造成的8月中旬至目前一直未办理工作交接和离职手续支付本人补偿。
帮助需求——就目前情况和所拥有的证据似乎对我没有太多有利的地方，请专业律师给与指点，我该如何进行后续工作？继续让步和公司协商，还是申请仲裁？谢谢！