在我国各学术机构，学政不分，成了学术变态的重要根源。多数学术腐败都与“官”有关。“一方面是官员当教授甚至有当院士的，这种现象严重，当了官就相当于有学术地位了，这种思维导致学术腐败；另一方面搞学术的人想当官，似乎不当官就难以体现自己的身价，同样导致学术腐败。又因为目前我们的学术机构尤其是高校始终突破不了”泛行政“的框架，行政意见依然是至高无上的力量，这就引出一个体制问题。学术机构体制缺乏独立性，仍实行官本位体制，院士是副部级的身价，校长是副部级的或厅级的身价，系主任是处级的身份等等，而由于他们本身就是官，科研体制纳入官僚体制，所有这些纠合在一起，”官场“所衍生出来的学术腐败就在所难免。” （陈光明：《学术领域拒绝官》 经理学苑网2005年2月16日，//www.vcmc.net/fudao/read.php？id=5582） 我有一位从事学术研究颇有成就的朋友，是教授和博士生导师，但同时担任了所在高校的研究生处副处长，长期纠緾于具体的行政事务中，我不解的问他，快50岁的人了，再升官的可能性很小了，为什么不集中精力搞好教学科研，带好学生，而去担任一个事实上与学术没有多大关系的级别不高的行政职务呢？在交谈中得知，因为只有当官才能“有机会”搞好学术，一方面现在的岗位聘任、收入多少与申请的科研项目挂勾，而在本校和校外是否能够申报项目、评奖是否能够成功与其行政头衔也有很大的关系，可以说是为了学术而当官，因为有一定的行政职务，就在学校的学术事务中的一定的发言权；担任行政职务往往也是在众多学术机构中担任评委等学术职务的基础；担任大学行政职务，就有机会与政府学术管理部门交流“勾兑”。可以说，只有在学术单位担任一定的行政职务才能在学术竞争中获得平等待遇。由于项目多，同时承担多个项目，其完成的质量就会出现问题，但由于成果鉴定机制不完善，粗制滥造也能顺利过关。

　　这种“平等待遇”的后果是，一些担任行政职务的学者利用这种学政不分的身分拥有了大量的项目，获得各奖励。担任某大学党委副书记的教授，在2003、2004两年内，承担国家和省市项目13项。（大家可查阅某大学《2003-2004科研项目统计表》： //www.cqu.edu.cn/yuanxishezhi/maofa/maoxing/jy/kt2003_2004.htm）大，难以想象他能在当好党委书记的同时，能够同时进行13个大型项目的研究工作。各科研学术单位的官员们“仕而优则学”，利用自己的行政权力分配学术资源，学术资源又成为他们拉帮结派，整合政治资源的工具。

　　正如邓晓芒教授指出：我国大学的“学校建制最开始只有校系两层，中间的科、处两级（卫生科、财务科、学生科、教务处、研究生处等等）虽然是官僚机构，但毕竟直接具有服务功能，现在却已发展成庞大臃肿的一堆烂肉。拿我所在的学校来说，在”合校“（四校合一）之后，就有系、院、部、校四级，有的”院“其实就是原来的一个”系“，而”部“级的设立更是荒唐透顶。当时绝大部分教师都反对设”部“一级，校方的解释却是：这一级不是一个独立的行政级别，而是为了工作方便而设的一个联络机构。但实际上，多一级建制就多一批不干实事而专门制造麻烦的干部，教师的意见要能上达学校领导就多一层障碍。当时我就说，这不是什么”世界一流的大学“，而是”世界一流的衙门“！ ” （邓晓芒：《究竟是“世界一流的大学”还是“世界一流的衙门”？——关于大学体制改革的思考科友留学网，2005年3月13晶日，//www.key.org.cn/Article_Show.asp？ArticleID=1167）现行的学术体制，如职称评定制度、科研成果评审和奖励制度（学术评价体制）、科研人员年度考核制度、学位点和博士后流动站的建点和导师遴选制度、研究生培养及学位授予制度、“项目”或“课题”制，等等。都存在权学不分的情况。掌握行政权力的学者们，利用自己手中掌握的主持和参与职称评定、课题立项、成果鉴定、奖励的审定等工作的便利，不正当、不合理地行使职权。周祥森先生举例说：“搞门户之见、亲疏之分的评审，或坦然收受他人的贿赂；利用主持”项目“、”课题“或”工程“、计划、经费等的大权，轻易地把别人的劳动据为己有，做其”正当“的、”合法“的”空头主持人“；利用对申请博士、硕士或博士后点的建点单位的评估权，四出”讲学“，心安理得地享受对方所提供的”超乎寻常的接待“，或接受对方登门而来的馈送；利用招生权和学位授予权，大搞权权、权钱和权学三结合的交易，为那些企图谋取博士学位以便给自己脸上贴金的政府官员、”款爷“、”大腕“获取学位大开绿灯，甚至聘其为博导。”（周祥森：学术腐败的根源与遏制，来源：史学评论网//www.acriticism.com/newslist.asp？type=1001 在笔者所工作过的一所大学，就有没有研究生学历和硕士学位，也没有发表论文和出版科研成果的几位厅级干部，轻而易举地考上了博士研究生。这些人没有硕士学位，按同等学历处理，而所谓同等学历是否达到了考博士的学术水平、外语成绩不够是否破格录取，这本是一种学术评判，但学校以为了学校的知名度为名，以行政权力决定录取。