随后，紫金矿业意欲回归中国内地A股市场。不过，2007年11月30日，原国家环保总局在其上市前审查中发现紫金矿业存在不良环境记录。

　　这项举措被称为“绿色证券”。早在2001年，原国家环保总局就下发通知，要求各上市公司在上市前必须接受环保情况核查，以避免募集资金投向对环境造成严重污染和破坏的项目。

　　2007年，在首批“绿色证券”试点被核查的37家企业中，有十家未能通过或暂缓通过，其中便有紫金矿业——紫金矿业当时新收购的湖南衡阳尚卿矿业有限公司(下称尚卿矿业)等五家公司环保基础较差。

　　紫金矿业随即致函原国家环保总局，反映剥离这五家企业的难度很大，并承诺在完成补办环保手续、完善环保设施工作前无限期停产。之后，尚卿矿业等企业未被纳入环保核查范围，紫金矿业得以顺利上市。

　　但环保部今年5月的通报显示，尚卿矿业仍然问题多多：其铁矿采选工程2004年投产，但三年后才补齐环评，至检查时尚未进行环保竣工验收;废水处理设施不完善;尾矿库无截污沟，易向下游溢流污水，存在较大环境安全隐患。

　　在2006年11月接手尚卿矿业的紫金矿业则回应称，2009年5月，已经将所持尚卿矿业的全部股权进行转让，目前该公司已不属于紫金矿业所有。紫金矿业同时表示，鑫丰矿业的股份也将被出售。

　　知情人士分析紫金矿业这一举措的原因时提到，由于当地品位好的金矿已被开采殆尽，紫金矿业在湖南的公司近年来处于亏损状态，鑫丰矿业更是三天两头因各种原因停产。

　　分析人士还质疑说，对于环保未达标的子公司，一卖了之，是否就能推卸自身的环保责任?

　　除了此次环保部通报提及的种种问题，紫金矿业在贵州、河北等地的下属公司也屡屡出现尾矿库泄露等污染。在民间组织公众环境研究中心与思汇政策研究所今年3月联合发布的一份香港上市企业环境表现报告中，对此有所披露。

　　早在2006年底，位于贵州省黔西南布依族苗族自治州贞丰县境内的紫金矿业贞丰水银洞金矿发生溃坝事故。尾矿库中约20万立方米含有剧毒氰化钾等成份的废渣废水溢出，下游两座水库受到污染。

　　2009年4月，紫金矿业位于河北张家口市崇礼县的东坪旧矿尾矿库回水系统发生泄漏事故。