证券法规定，综合类证券公司必须将其经纪业务和自营业务分开办理。这是因为，如果综合类证券公司的经纪业务和自营业务不分开办理，证券公司在自营业务中就可能为盈利而损害所代理的客户的利益。如，当股市不利时，先于客户委托抛出，反过来，又抢在客户之前买进；还可能在自营业务中挪用客户的资金和证券，这不但会妨害客户在证券交易中的权益，而且一旦自营业务发生严重亏损，就会使客户资金和证券遭到重大损失。所以，综合类证券公司的经纪业务和自营业务必须分开办理。
    为了使综合类证券公司的经纪业务和自营业务分开办理，证券法同时还规定，综合类证券公司在从事经纪业务和自营业务中，应当将这二种业务的业务人员、财务账户分开，不得混合操作。这是因为，业务人员分开了，自营业务人员和经纪业务人员就各做各的业务，就不容易发生上面所说的，证券公司业务人员"当股市不利时，先于客户抛出，反过来，又抢在客户之前买进"的现象；自营业务和经纪业务的财务账户分开了，就不容易发生证券公司挪用客户的资金和证券的现象。