一是单位贿赂腐败或单位贿赂犯罪，没有引起有关机关足够的重视处理上特别是刑事处罚上遇到很大阻力或麻烦。从媒体公开的报道看，不论是法纪部门，还是执法部门，办理的个人受贿案件、行贿案件的数量，要比单位受贿案件、行贿案件多得多。查办的单位贿赂腐败特别是单位贿赂犯罪案件不多，是因为一些主管部门、执法执纪机关在潜意识里把这种现象当成了行业或部门不正之风来对待，或者受地方或部门保护主义因素的影响，对涉案单位的主要领导、直接责任人纪律处分了事，而不是将其作为一种严重的腐败现象或犯罪来对待。如单位受贿，一些国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体，索取、非法收受他人财物，为他人谋取利益；在经济往来中，在账外暗中收受各种名义的回扣、手续费，往往将受贿款用于单位发展，或者为单位职工发奖金、福利——没有直接装入个人腰包，而是披上了“为公”的外衣，所以迷惑性很大。商业贿赂被社会认同为许多行业市场营销的“潜规则”，导致对单位商业贿赂认知的模糊。还停留在“随着商品经济的发展而产生的一种负面经济现象，是不可避免的”，而对商业贿赂的危害却熟视无睹。

　　二是查办案件取证难。单位贿赂腐败或单位贿赂犯罪中，大部分都有较高智商者充当其智囊团，作案前或作案中往往都有防查的准备和对策，作案的手段普遍存在隐蔽性，违纪的手段和方式也不断变换。在调查中，有的不愿作证，有的不敢作证，有的取不到证，有的是我们的办案手段受到政策规定的限制。调查取证难，这既增加了办案取证环节，扩大了案情的知晓面，增加了办案的难度，在一定程序上制约了纪检监察机关的办案取证工作。

　　三是查办案件阻力大、处理难。办案的困难和阻力来自多方面，既有有形的困难阻力和无形的困难阻力，也有上级领导的困难阻力和群众的困难阻力，还有政策规定不规范的困难和阻力。不少单位贿赂腐败或单位贿赂犯罪都具有两面性，一方面是业绩突出，他们的工作能力和业绩容易赢得组织和个别领导的过分信任和支持，也更容易掩盖他们腐败的另一面。另外，单位贿赂犯罪的主体往往在当地具有一定的影响力，且全国范围内普遍存在，有投鼠忌器、牵一发而动全身之滤。有关机关在查办这类犯罪案件时，一有动作，就会有来自方方面面的压力和阻力，甚至有来自领导的说情和压力。群众对腐败深恶痛绝，反映强烈，但在调查处理本单位的违纪违法问题时，由于群众涉及到自身利益就会顾虑重重，不愿作证、不敢作证，不愿支持配合。